Confira nessa matéria o porque você está recebendo essa mensagem de alerta e como resolver.
Esta registrada como bug 902183 e aparentemente a solução que encontraram foi a de exibir o alerta com a mensagem de se você que não criptografou seus discos possa remover o cryptsetup-initramfs, assim se livra da mensagem.
cryptsetup WARNING
A mensagem é de alerta por você não ter criptografado seus discos na instalação do sistema pelo instalador live Calamares.
Para remover use o comando.
sudo apt remove --purge cryptsetup-initramfs
Teste.
sudo update-initramfs -u
Pacote removido e mensagem também.
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