Debian biohackathon COVID-19

A comunidade Debian ira realizar um encontro virtual para melhorar os seus pacotes ligados a medicina, confira.







Biohackathon COVID-19



O anúncio foi feito em 27 de Março de 2020 por Andreas Tille


"Comunidade Debian,

Haverá uma biohackathon COVID-19 virtual (online) de 5 a 11 de abril,
2020 e a equipe Debian Med convidam você para ajudar a melhorar o software livre biomédico e as ferramentas / bibliotecas que suportam esses projetos.

A maioria das tarefas não requer nenhum conhecimento de biologia ou medicina, e todas tipos de contribuições são bem-vindos: triagem de erros, testes, documentação, Contribuições de IC, traduções, empacotamento e código."






1. Os bugs relacionados ao Debian podem ser visualizados em [covid19-bugs]

2. O software que aguarda empacotamento está listado em [covid-19-packages], por favor responda à RFP com sua intenção, para não duplicarmos o trabalho.

3. Você também pode contribuir diretamente para os pacotes upstream, vinculados da página de tarefas Debian Med COVID-19 em [covid-19-packages].

Nota: muitos pacotes de software biomédicos têm recursos limitados, mesmo
comparado a um projeto FOSS típico. Por favor, seja gentil com os responsaveis
autor / mantenedor e perceber que eles podem ter recursos limitados para
revisar sua contribuição. Triagem de problemas abertos e abertura de solicitações pull, corrigir problemas provavelmente será mais útil do que escolher seu estilo de codificação.

4. Arquiteturas / portabilidade: concentre-se no amd64, pois é a principal
arquitetura para software biomédico. Uma camada secundária seria arm64 /
ppc64el / s390x (mas cuidado com os problemas relacionados ao endian no s390x). A partir de um perspectiva de hardware livre / aberto, seria ótimo ver mais riscv64 suporte, mas isso não é uma prioridade no momento


5. A equipe Debian Med também está tentando melhorar a disponibilidade de
pipelines / fluxos de trabalho biomédicos automatizados [fluxos de trabalho robustos] usando o padrão aberto do Common Workflow Language. A implementação de referência de O CWL está escrito em Python e há muitos problemas abertos prontos para o trabalho que não exigem nenhum conhecimento biomédico [cwltool-issues]

6. É muito fácil contribuir com a equipe Debian Med. Temos um baixo NMU
política para todos os nossos pacotes. As solicitações de mesclagem no Salsa geralmente são processados ​​rapidamente (mas efetue o ping em alguns dos mais recentes Uploaders do pacote para garantir que será notado). Ainda melhor se você pedir associação à equipe e envie diretamente para o repositório de salsa.

7. A [debian-med-team-policy] deve responder a todas as perguntas sobre como
contribuir.



A biohackathon da COVID-19 está sendo organizada em [covid-19-bh20] e para a participação do Debian, estamos usando [salsa-covid-19-bh20]

Fonte


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